■文、图/记者 杨天娇 特约记者 黄卉 通讯员 张琴
凌晨3点,当大多数人都在睡梦中时,市疾控中心大楼依然灯火通明。在实验室忙碌的,是30岁的黄强,他曾支援上海抗疫。面对十堰突发的新一轮疫情,黄强勇挑重担,成为十堰唯一一名承担新冠基因序列检测任务的工作人员。
随着精准防控的深入开展,“基因测序”一词越来越普及。除了核酸检测结果,大家也开始关注样本基因测序的结果。疫情从何而来?又在哪条传播链上?这些问题都要由基因测序一一解开。协助溯源病毒、监控病毒变异趋势、掌握病毒的发展方向,是疫情时期基因测序的主要目的。
8月10日,当第一例阳性感染者出现后,市疾控中心便一直承担着全市新冠病毒阳性样本的基因测序工作。在一个多星期的时间里,黄强完成23个样本的检测,初步判定了疫情来源以及十堰的传播链。
“通过检测新冠病毒的全基因组序列,再将这个序列通过算法与数据库中的数据进行比对,可以初步判断病毒分支类型,是否与省内或国内其他地域流行株相同。将序列与既往病例序列进行比对,如果序列在同一进化树分支上,则可以判断这些病例是否来自同一传播链或传染源。”黄强尽可能用简洁易懂的语言来解释复杂的原理,他的工作也是防疫的关键。
在实验室,黄强一待就是10多个小时。按照标准化流程,从样本准备、病毒基因组全长捕获、文库构建到上机测序和生物信息学分析,整个测序的过程不能断,需要一直操作。“基本上完成这个流程就需要约13小时。”因为样本全都来自阳性感染者,黄强不得不在实验室长时间穿密不透风的防护服。
“处理一批样本比做两小时的核心力量训练还要累。”黄强说,看似简单易上手的操作暗含着各种奥妙,整个步骤繁琐且耗时长,对精度与速度的要求都很高,某个环节稍有疏忽就可能前功尽弃,影响到整个基因测序的结果。“考虑到注意力无法长时间高度集中,我有时会叫上一名同事和我一起待在实验室,对实验过程进行提醒和监督。”为了确保检验的准确性,黄强通宵达旦工作成了家常便饭。“什么时候处理完,就什么时候休息。”黄强说,穿脱防护服非常麻烦,使用多套防护服又浪费资源,所以他吃饭根本没有固定时间。
黄强介绍,目前,十堰已完成3轮新冠病毒基因序列检测工作。由于样本通常是随到随测,为了提高效率,他常常将等待样本上机检测的时间充分利用起来,在机器运转的同时进行上一批样本的数据分析和下一批样本的构建工作,保证机器和人力的时刻运转。
一轮样本的检测,需要耗费13小时左右,机器运作约24小时,从拿到样本到最终出结果至少需要36小时。对于黄强而言,更快更准确地得到结果十分关键。“早一个小时出结果,也许就能早一个小时完成病毒溯源,也就能早一个小时理清传播链条。我的工作就是与病毒赛跑,而且必须要跑在前面。”黄强说。

黄强通过仪器认真提取样本。

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